合理確定高效過濾器以及各級過濾器效率是生產部節約成本的關鍵。一般而言，最末端的高效過濾器決定送風的潔凈程度，上游各級過濾器起保護作用，它保護末端的過濾器效率與末端的過濾器使用壽命或確保其正常工作。

設計時，應首先根據潔凈室潔凈度的送風要求來確定末級過濾器的效率，然后選擇起保護作用的各級過濾器過濾效率，如果這過濾器需要保護，則在它的上一級增設過濾器作為預級保護；應妥善匹配各級過濾器的效率，若相鄰兩級過濾器效率相差太大，則前一級起不到保護的作用。如：G級過濾→F級過濾→H級過濾→U級過濾。

選擇預級過濾時要將使用環境、運行能耗等等綜合因素考慮進去再決定各級送風量與過濾效率。潔凈室末端高效過濾器（HEPA）過濾器前要有效率不低于F8的過濾器來保護，甚至高效過濾器（HEPA）過濾器前可選用F9-H11的預級過濾器來作保護。空調系統本身應有效率不低于F5的預級過濾器來保護，在空調過濾器預級過濾中目前常見的是G3-F6.

合理確定高效過濾器以及各級過濾器效率的優點是：末端級過濾器的性能可靠，預級過濾器的效率合理壽命長，初級過濾與預級過濾器維護方便。